MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica LVS chromosome

Total Repeats: 37907

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007880	A	8	8	298	305	100 %	0 %	0 %	0 %	89255450
2	NC_007880	A	9	9	307	315	100 %	0 %	0 %	0 %	89255450
3	NC_007880	A	6	6	410	415	100 %	0 %	0 %	0 %	89255450
4	NC_007880	CAA	2	6	450	455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89255450
5	NC_007880	ATT	2	6	482	487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89255450
6	NC_007880	TAA	2	6	496	501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255450
7	NC_007880	A	6	6	500	505	100 %	0 %	0 %	0 %	89255450
8	NC_007880	A	6	6	516	521	100 %	0 %	0 %	0 %	89255450
9	NC_007880	T	7	7	556	562	0 %	100 %	0 %	0 %	89255450
10	NC_007880	CAA	2	6	567	572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89255450
11	NC_007880	AGA	2	6	595	600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89255450
12	NC_007880	AGT	2	6	607	612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255450
13	NC_007880	AAG	2	6	632	637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89255450
14	NC_007880	TCA	2	6	659	664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255450
15	NC_007880	AGA	2	6	709	714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89255450
16	NC_007880	TGT	2	6	769	774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89255450
17	NC_007880	AGC	2	6	799	804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255450
18	NC_007880	TGG	2	6	859	864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89255450
19	NC_007880	GCAA	2	8	892	899	50 %	0 %	25 %	25 %	89255450
20	NC_007880	ATT	2	6	938	943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89255450
21	NC_007880	TTA	2	6	963	968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89255450
22	NC_007880	CAAGAT	2	12	995	1006	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	89255450
23	NC_007880	TGAT	2	8	1044	1051	25 %	50 %	25 %	0 %	89255450
24	NC_007880	GAA	2	6	1181	1186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89255450
25	NC_007880	A	6	6	1268	1273	100 %	0 %	0 %	0 %	89255450
26	NC_007880	CAG	2	6	1308	1313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255450
27	NC_007880	GTAC	2	8	1331	1338	25 %	25 %	25 %	25 %	89255450
28	NC_007880	TAC	2	6	1378	1383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255450
29	NC_007880	CTA	2	6	1407	1412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255450
30	NC_007880	GCTT	2	8	1427	1434	0 %	50 %	25 %	25 %	89255450
31	NC_007880	AAGAA	2	10	1455	1464	80 %	0 %	20 %	0 %	89255450
32	NC_007880	ATA	2	6	1476	1481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255450
33	NC_007880	GTT	2	6	1490	1495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89255450
34	NC_007880	AAG	2	6	1540	1545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89255450
35	NC_007880	TGG	2	6	1633	1638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89255450
36	NC_007880	ATGC	2	8	1658	1665	25 %	25 %	25 %	25 %	89255450
37	NC_007880	GAT	2	6	1712	1717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255450
38	NC_007880	TAAA	2	8	1748	1755	75 %	25 %	0 %	0 %	89255450
39	NC_007880	A	6	6	1782	1787	100 %	0 %	0 %	0 %	89255451
40	NC_007880	TAT	2	6	1872	1877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89255451
41	NC_007880	ATA	3	9	1899	1907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255451
42	NC_007880	AGTT	2	8	1960	1967	25 %	50 %	25 %	0 %	89255451
43	NC_007880	TGAT	2	8	2043	2050	25 %	50 %	25 %	0 %	89255451
44	NC_007880	TAA	2	6	2086	2091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255451
45	NC_007880	AGCA	2	8	2157	2164	50 %	0 %	25 %	25 %	89255451
46	NC_007880	CAA	2	6	2180	2185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89255451
47	NC_007880	TCA	2	6	2191	2196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255451
48	NC_007880	TAT	2	6	2197	2202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89255451
49	NC_007880	ATG	2	6	2229	2234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255451
50	NC_007880	CTA	2	6	2282	2287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255451
51	NC_007880	A	7	7	2380	2386	100 %	0 %	0 %	0 %	89255451
52	NC_007880	AGA	2	6	2422	2427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89255451
53	NC_007880	ATA	2	6	2544	2549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255451
54	NC_007880	ATT	2	6	2590	2595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89255451
55	NC_007880	TAA	2	6	2674	2679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255451
56	NC_007880	GAA	2	6	2789	2794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89255451
57	NC_007880	TCTA	2	8	2801	2808	25 %	50 %	0 %	25 %	89255451
58	NC_007880	ATA	2	6	2853	2858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255451
59	NC_007880	GTTT	2	8	2859	2866	0 %	75 %	25 %	0 %	89255451
60	NC_007880	ATT	2	6	2867	2872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89255451
61	NC_007880	TAA	2	6	2892	2897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255452
62	NC_007880	GAAT	2	8	2935	2942	50 %	25 %	25 %	0 %	89255452
63	NC_007880	A	7	7	2954	2960	100 %	0 %	0 %	0 %	89255452
64	NC_007880	TA	3	6	2977	2982	50 %	50 %	0 %	0 %	89255452
65	NC_007880	AGT	3	9	3007	3015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255452
66	NC_007880	TAA	2	6	3019	3024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255452
67	NC_007880	TATTTC	2	12	3093	3104	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	89255452
68	NC_007880	CAC	2	6	3153	3158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89255452
69	NC_007880	A	6	6	3174	3179	100 %	0 %	0 %	0 %	89255452
70	NC_007880	TGA	2	6	3197	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255452
71	NC_007880	T	6	6	3203	3208	0 %	100 %	0 %	0 %	89255452
72	NC_007880	ATA	2	6	3209	3214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255452
73	NC_007880	T	6	6	3271	3276	0 %	100 %	0 %	0 %	89255452
74	NC_007880	ACC	2	6	3277	3282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89255452
75	NC_007880	AT	3	6	3296	3301	50 %	50 %	0 %	0 %	89255452
76	NC_007880	GAA	2	6	3314	3319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89255452
77	NC_007880	TAT	2	6	3395	3400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89255453
78	NC_007880	T	7	7	3416	3422	0 %	100 %	0 %	0 %	89255453
79	NC_007880	ATA	2	6	3479	3484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255453
80	NC_007880	TAG	2	6	3557	3562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255453
81	NC_007880	ATG	2	6	3575	3580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255453
82	NC_007880	CAA	2	6	3683	3688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89255453
83	NC_007880	CTT	3	9	3691	3699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89255453
84	NC_007880	CAC	2	6	3781	3786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89255453
85	NC_007880	TA	3	6	3795	3800	50 %	50 %	0 %	0 %	89255453
86	NC_007880	TA	3	6	3837	3842	50 %	50 %	0 %	0 %	89255453
87	NC_007880	TTCTT	2	10	3858	3867	0 %	80 %	0 %	20 %	89255453
88	NC_007880	T	7	7	3886	3892	0 %	100 %	0 %	0 %	89255453
89	NC_007880	CTT	2	6	3933	3938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89255453
90	NC_007880	CTT	2	6	3958	3963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89255453
91	NC_007880	GAT	2	6	3988	3993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255453
92	NC_007880	TCAA	2	8	4008	4015	50 %	25 %	0 %	25 %	89255453
93	NC_007880	CAAC	2	8	4047	4054	50 %	0 %	0 %	50 %	89255453
94	NC_007880	CCTTG	2	10	4056	4065	0 %	40 %	20 %	40 %	89255453
95	NC_007880	AAC	2	6	4106	4111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89255453
96	NC_007880	A	6	6	4130	4135	100 %	0 %	0 %	0 %	89255453
97	NC_007880	CTT	2	6	4162	4167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89255453
98	NC_007880	ATTA	2	8	4175	4182	50 %	50 %	0 %	0 %	89255453
99	NC_007880	ATG	2	6	4207	4212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255453
100	NC_007880	GGT	2	6	4327	4332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89255454
101	NC_007880	TAC	2	6	4346	4351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255454
102	NC_007880	TGA	2	6	4373	4378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255454
103	NC_007880	GAT	2	6	4387	4392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255454
104	NC_007880	TTA	2	6	4484	4489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89255454
105	NC_007880	CAA	2	6	4519	4524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89255454
106	NC_007880	GT	3	6	4526	4531	0 %	50 %	50 %	0 %	89255454
107	NC_007880	TGA	2	6	4575	4580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255454
108	NC_007880	ATT	2	6	4581	4586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89255454
109	NC_007880	TGTT	2	8	4598	4605	0 %	75 %	25 %	0 %	89255454
110	NC_007880	GGTA	2	8	4608	4615	25 %	25 %	50 %	0 %	89255454
111	NC_007880	AT	3	6	4647	4652	50 %	50 %	0 %	0 %	89255454
112	NC_007880	AAT	2	6	4662	4667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255454
113	NC_007880	GGT	2	6	4792	4797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89255454
114	NC_007880	T	6	6	4850	4855	0 %	100 %	0 %	0 %	89255454
115	NC_007880	TA	3	6	4864	4869	50 %	50 %	0 %	0 %	89255454
116	NC_007880	TAG	2	6	4942	4947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255454
117	NC_007880	ATT	2	6	4978	4983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89255455
118	NC_007880	GAA	2	6	4984	4989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89255455
119	NC_007880	TA	4	8	5032	5039	50 %	50 %	0 %	0 %	89255455
120	NC_007880	CT	3	6	5053	5058	0 %	50 %	0 %	50 %	89255455
121	NC_007880	T	6	6	5062	5067	0 %	100 %	0 %	0 %	89255455
122	NC_007880	TTC	2	6	5083	5088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89255455
123	NC_007880	ATC	2	6	5167	5172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255455
124	NC_007880	CAT	2	6	5220	5225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255455
125	NC_007880	ATA	2	6	5240	5245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255455
126	NC_007880	ATTT	2	8	5248	5255	25 %	75 %	0 %	0 %	89255455
127	NC_007880	TGG	2	6	5294	5299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89255455
128	NC_007880	GCA	2	6	5360	5365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255455
129	NC_007880	TTGA	2	8	5398	5405	25 %	50 %	25 %	0 %	89255455
130	NC_007880	ACA	2	6	5468	5473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89255455
131	NC_007880	TA	3	6	5511	5516	50 %	50 %	0 %	0 %	89255455
132	NC_007880	TTTC	2	8	5535	5542	0 %	75 %	0 %	25 %	89255455
133	NC_007880	TAG	2	6	5547	5552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255455
134	NC_007880	TAA	2	6	5611	5616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255455
135	NC_007880	AGT	2	6	5624	5629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255455
136	NC_007880	TTTA	2	8	5698	5705	25 %	75 %	0 %	0 %	89255455
137	NC_007880	ATT	2	6	5713	5718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89255455
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